Au terme de la loi de réforme portuaire, le conseil d’adminsitration du port autonom est dissous pour laisser la place à une nouvelle structure de commandement.
Le conseil d’administration du port autonome de Marseilles et ses 26 membres s’efface devant la nouvelle structure juridique de ce qui s’applle désormais « le grand port maritime de Marseille ». Cette nouvelle organisation comporte une conseil de surveillance de 17 membres et un conseil de développement de 40 membres (dont 30% de représentants des ports et 30% de représentants des collectivités territoriales). La direction opérationnelle du port va être assumée par un directoire composé de quatre membres, dont le président sera désigné par l’Etat après avis conforme du conseil de surveillance.